平安遷都１１００年を記念して明治２８年（１８９５）に建設され、遷都のおや神様である桓武天皇をまつっています。高さ２４ｍの大鳥居や大極殿がその当時の華やかさを偲ばせます。

平安京の宮殿建築を約８分の５スケールで再現し、東西南北の４つのエリアからなる神苑は総面積３万３０００㎡。近代庭園の先駆者、小川治兵衛によって作られました。

約１５０本の八重紅しだれ桜が咲く南神苑、約２００種２０００株の花菖蒲が池の水面を彩る西神苑、１０００株の杜若で水面が紫に染まる中神苑、御所から移された尚美館（貴賓館）と秦平閣（橋殿）が建つ東神苑を順に拝観するようになっています。